Soud shledal hlavní nedostatky Zásad v posouzení vlivů na životní prostředí (neposouzení synergických vlivů různých záměrů obsažených v Zásadách, neposouzení mimoúrovňových křižovatek a přivaděčů a celkově přílišná obecnost vyhodnocení) a vlivů na síť NATURA 2000. Soud rovněž považoval za nedostatečné vypořádání námitek zástupce veřejnosti.